El nombre de la estación es directo y descriptivo. **Pinar de Chamartín** significa el pinar de Chamartín: un nombre de paisaje que ya identificaba la zona antes de convertirse en el nombre de un gran intercambiador. La estación está en el barrio municipal de Costillares, en Ciudad Lineal, pero el entorno sigue reconociéndose habitualmente como Pinar de Chamartín.
La segunda parte del nombre remite a Chamartín de la Rosa, antiguo municipio independiente al norte de Madrid. La documentación del Archivo de Villa muestra que Chamartín de la Rosa conservó fondos municipales propios hasta la década de 1940 y fue anexionado a Madrid por decreto de 1947, con incorporación efectiva en 1948. Las descripciones municipales antiguas sitúan en ese paisaje fincas nobiliarias, terrenos rurales y el casco histórico de la villa.
La palabra **Chamartín** tiene además una etimología más profunda. Toponomasticon Hispaniae la interpreta como un topónimo de repoblación formado a partir de nombres personales, entre ellos Martín, y no como las explicaciones populares posteriores sobre un fondista francés o una frase de taberna. Para esta estación, sin embargo, el origen inmediato no es toda la etimología medieval de Chamartín, sino la expresión local más reciente “pinar de Chamartín”.
Una memoria local muy conocida vincula el pinar con Napoleón. Tras Somosierra, Napoleón permaneció en Chamartín aproximadamente del 2 al 22 de diciembre de 1808 mientras Madrid capitulaba; después la tradición habló de un gran “Pino de Napoleón” bajo el que supuestamente descansaba o preparaba sus planes. Algunas fuentes describen el árbol como un hito real, pero tratan el uso concreto por parte del emperador como tradición oral más que como hecho plenamente documentado.
El nombre de transporte quedó fijado con la ampliación de la red en 2007. Las líneas 1 y 4 de Metro llegaron a Pinar de Chamartín el 11 de abril de 2007, y la línea ML1 de Metro Ligero abrió desde allí hasta Las Tablas el 24 de mayo de 2007. La estación conserva así un antiguo nombre de paisaje justo en el punto donde una antigua periferia rural se convirtió en intercambiador moderno.