La estación de El Carmen conserva el nombre de un edificio religioso desaparecido: la Capilla del Carmen. La historia oficial de la cercana Parroquia del Espíritu Santo afirma de forma explícita que el Metro El Carmen tomó su nombre de aquella capilla, situada en la actual calle de Alcalá 246, junto al ámbito de la estación.
La capilla pertenecía a un paisaje mucho más antiguo de borde urbano en torno al Puente de Ventas. Allí se cruzaban el camino hacia Alcalá, después carretera de Aragón y hoy calle de Alcalá, con el arroyo Abroñigal, actualmente soterrado bajo la M-30. Al oeste del arroyo terminaba Madrid; al este empezaba entonces Vicálvaro, donde a comienzos del siglo XX creció una barriada pobre y muy poblada.
La Capilla del Carmen se abrió al culto público en 1928 en la carretera de Aragón 40. La historia parroquial la vincula con la Congregación de las Damas Apostólicas del Corazón de Jesús y la describe como capilla y escuela, creada para atender a familias humildes, niños y barrios marginados del entorno de Las Ventas. Su advocación remite a Nuestra Señora del Carmen, la Virgen del Carmen, pero el origen inmediato del nombre de la estación es la capilla local.
Después de la Guerra Civil, la capilla pasó a tener una función mayor que la de simple templo dependiente. El 29 de junio de 1940 se erigió canónicamente allí la Parroquia del Espíritu Santo, recuperando el nombre histórico de la zona de las Ventas del Espíritu Santo mientras usaba la antigua Capilla del Carmen como primera sede. Con la urbanización y el crecimiento del distrito, el pequeño edificio quedó insuficiente; el templo parroquial actual de la calle Ricardo Ortiz fue inaugurado y consagrado en 1968.
El Metro llegó en 1964, cuando El Carmen abrió en el tramo Ventas-Ciudad Lineal, explotado al principio como parte de la línea 2 e integrado después en la línea 5 el 20 de julio de 1970. La capilla desapareció y la parroquia se trasladó desde la calle de Alcalá, pero la estación conservó aquel nombre local. La evidencia es sólida para identificar la capilla como origen directo; la figura religiosa de fondo es la Virgen del Carmen.