Empalme es uno de los nombres más literales del Metro de Madrid. En español, un empalme es un punto de unión, conexión o enlace, y el diccionario de la RAE recoge también el uso referido a medios de transporte que se unen o combinan. Aquí la palabra no era decorativa: describía la función ferroviaria del lugar.
La línea antigua que está detrás del nombre fue el ferrocarril Madrid-Almorox, una ruta de vía estrecha cuyo primer tramo se abrió en julio de 1891 entre Madrid y Navalcarnero y que después se prolongó hacia Villa del Prado y Almorox. Su cabecera madrileña era la estación de Goya, cerca del antiguo entorno de la Quinta del Sordo junto al Puente de Segovia. El ferrocarril servía tanto al tráfico agrícola de las zonas del Guadarrama y el Alberche como a viajeros de ocio, pero su terminal poco céntrica y la competencia de la carretera contribuyeron a su declive.
Cuando se proyectó y construyó el Ferrocarril Suburbano de Carabanchel, el trazado cruzaba el Madrid-Almorox cerca de la estación actual. Una fuente sobre la historia urbana de Aluche indica que el proyecto del Suburbano añadió un apeadero para conectar con el tren de Almorox, llamado inicialmente Madrid-Empalme o Goya-Empalme, y que finalmente quedó con el nombre abreviado de Empalme. La cronología histórica del Consorcio Regional de Transportes de Madrid también identifica Empalme como estación del Suburbano con conexión con el ferrocarril Madrid-Almorox.
La cronología del transporte es importante porque la etiqueta actual de línea 5 es posterior a la estación. Empalme nació como parte del Ferrocarril Suburbano, no como estación de la línea 5; la cronología del CRTM señala que pasó a la línea 10 el 17 de diciembre de 1981 y a la línea 5 el 22 de octubre de 2002. Así se entiende que una estación de la línea 5 actual conserve un nombre heredado de un antiguo intercambio ferroviario.
El origen, por tanto, está bien respaldado, aunque algunos detalles finos requieren cautela. El nombre Empalme es seguro; la fórmula exacta del nombre temprano lo es menos, porque una fuente disponible más sólida da Madrid-Empalme o Goya-Empalme, no el Empalme-Goya de la redacción de partida. También hay una discrepancia de fecha: la cronología histórica del CRTM lista Empalme el 4 de febrero de 1961, mientras que otra fuente de historia del transporte da el 1 de abril de 1961 y el extracto de Aluche afirma que Empalme abrió dos meses después del resto del Suburbano.