El nombre de la estación se entiende primero como nombre de campus. Universidad Rey Juan Carlos es la parada de la línea 12 situada en la calle Tulipán de Móstoles, junto al acceso al campus mostoleño de la Universidad Rey Juan Carlos. La documentación de MetroSur de la Comunidad de Madrid ubica allí la estación y la describe como próxima al acceso del campus universitario y a la calle Alcalde de Móstoles.
Detrás de ese nombre de campus hay una dedicatoria institucional fijada por ley. La Ley 7/1996 de la Comunidad de Madrid, de 8 de julio de 1996, creó la Universidad «Rey Juan Carlos». La norma no desarrolla una explicación toponímica aparte: el nombre elegido vinculaba públicamente la nueva universidad pública madrileña con Juan Carlos I, entonces rey de España.
La cronología es importante porque la universidad y la estación pertenecen a una misma etapa de expansión del sur madrileño entre finales de los años noventa y comienzos de los dos mil. La propia página del 25 aniversario de la URJC indica que la universidad nació conforme a su ley de creación y comenzó su actividad académica en octubre de 1997. La prensa de la época recogió la apertura oficial del primer curso con 300 alumnos y edificios prestados en Alcorcón y Móstoles, antes de que estuviera completada la trama permanente del campus.
MetroSur dio después una dirección ferroviaria a ese nuevo paisaje universitario. La línea 12 se concibió como un metro circular para enlazar Alcorcón, Móstoles, Fuenlabrada, Getafe y Leganés, y la página regional de transporte la presenta como una gran infraestructura para la corona sur metropolitana. En Móstoles, la página municipal de movilidad incluye Universidad Rey Juan Carlos entre las estaciones de la línea 12 del municipio.
Para una explicación pública, conviene no decir que Metro bautizó directamente una estación en honor de Juan Carlos I. La estación tomó el nombre de la universidad y de su campus, mientras que la universidad sí lleva el nombre del rey. No se ha encontrado un nombre anterior de la estación; el nombre actual parece estar en uso desde la apertura de MetroSur en 2003.